或许过去又或许未来人类大规模向宇宙殖民当人口膨胀到五千亿的时候散落在宇宙各个角落的人类返回故土地球却引发了伤亡惨重的归乡战争为了保护地球这片圣地人类制定了盖亚制裁约定不许任何人染指这里可是曾经作为联合舰队舰长的哈洛克（小栗旬 配音）却背叛盖亚制裁驾驶着他的阿尔卡迪亚号高举叛旗成为逃逸一百年之久的通缉犯联合舰队长官伊索拉（森川智之 配音）指使自己的弟弟亚马（三浦春马 配音）混入阿尔卡迪亚号探寻尼伯龙根人发明的永动机的秘密在此期间哈洛克率领船员向地球挺近而联合舰队则在太阳系布下天罗地网阻挡他的步伐遥远的故土失落已久的真相令所有人为之震惊……　　本片根据松本零士的经典科幻漫画改编